Per i suoi meriti scientifici fu insignito di diversi e prestigiosi riconoscimenti internazionali. A lui è intitolata una prestigiosa onorificenza, la Medaglia Albert Defant, istituita dalla Società Meteorologica Tedesca per premiare ricercatori che abbiano conseguito risultati di prim’ordine in oceanografia fisica.

I suoi eccellenti rapporti, personali e scientifici, con gli scienziati scandinavi sono documentati anche dalle numerose onorificenze : la Medaglia Vega della Reale Società Geografica Svedese (1932), la Medaglia Galathea della Reale Società Geografica Danese di Copenaghen (1936), la nomina a membro dell’Accademia Finlandese delle Scienze di Helsinki (1942), la Reale Accademia delle Sciences di Göteborg in Svezia (1939), della Reale Academia Svedese delle Scienze di Stoccolma (1945) e dell’Accademia Norvegese di Scienze e Lettere di Oslo (1964).

Defant fu anche tenuto in altissima considerazione da altre nazioni, come documentato dal conferimento della Medaglia Agassiz dell’Accademia Nazionale delle Scienze, Washington, D.C. (1933), della medaglia d’oro all’onore della Società Oceanografica del Giappone di Tokyo (1975), così come la affiliazione onoraria alla Società Geografica Russa di Leningrado (1938), alla Società Geografica Olandese di Amsterdam (1939) e all’Accademia delle Scienze di New York (1949).

Grazie ai suoi risultati scientifici e alla sua leadership nell’organizzare la ricerca ai massimi livelli, le onorificenze scientifiche in Germania e in Austria furono diverse: fu membro dell’Accademia Leopoldina delle Scienze di Halle (1919), dell’Accademia Prussiana delle Scienze di Berlino (1935), dell’Accademia delle Scienze di Gottinga (1935), dell’Accademia Austriaca delle Scienze di Vienna (1939), dell’Accademia di Scienze e Lettere di Magonza (1949) e dell’Accademia Bavarese delle Scienze di Monaco (1951), socio onorario della Società per la Scienza e la Medicina di Innsbruck (1926), della Società Geografica della Pomerania di Greifswald (1939) e della Commissione Scientifica Tedesca per la Ricerca Marina (1956).

Ricevette numerose medaglie e premi: il Premio Ludwig Haitinger dell’Accademia Reale delle Scienze di Vienna (1912), il Premio Ackermann dell’Università di Lipsia (1928), il Premio Arrhenius dell’Università di Lipsia (1943), l’Anello d’Onore della Società Austriaca della Lega delle Nazioni Unite di Vienna (1947), la Medaglia d’oro Wiechert Medal della Società Geofisica Tedesca (1956), la Medaglia Joachim Jungius dell’Università di Amburgo (1963), la Medaglia d’oro dell’anniversario dell’Università di Innsbruck (1974), e l’Onorificenza Austriaca per la Scienza e per l’Arte di Vienna (1974).

Gli fu attribuito un dottorato ad honorem dalla Libera Università di Berlino (1958), e nel 1962 fu creato Ritter der Friedensklasse dell’Ordine „Pour le mérite”, un premio prestigioso che risale a una proposta di Alexander von Humboldt nel 1842, ed è stato assegnato solo a un ristretto numero di scienziati ed artisti. Un numero speciale gli fu dedicato in occasione del 60° compleanno dalla rivista Die Naturiwissenchaften nel 1944 e per il 70° compleanno dalla rivista Archiv für Meteorologie, Geophysik und Bioklimatologie nel 1954.